解码作物近缘的重要野生种基因组并挖掘其优异抗逆基因应用于栽培作物的遗传改良将极大地丰富作物的遗传基础，助力粮食安全和绿色农业发展。
近日，棉花生物学国家重点实验室公布了具有抗病和腺体延缓形成等优良性状的澳洲棉（Gossypiumaustrale）高质量、从头组装的基因组。年9月3日相关研究成果在线发表于PlantBiotechnologyJournal杂志。
二倍体野生棉种澳洲棉具有抗*萎病、抗枯萎病、抗旱和腺体延缓形成（种子无腺体而植株有腺体）等优良性状。澳洲棉全基因组测序对于深入了解棉属植物进化历史，推动棉花抗逆育种和棉花种子蛋白与油脂资源的安全有效利用、助力粮食安全具有重要意义。研究人员通过整合PacBio，Illuminashortread，BioNano（DLS）和Hi-C技术获得了高质量的澳洲棉基因组，其ContigN50为1.83Mb，ScaffoldN50为.60Mb。通过比较基因组分析发现，澳洲棉相对于雷蒙德氏棉而言与亚洲棉亲缘关系更近，在大约6.6百万年前分化为两个不同的种。
通过多组学、正向选择分析和基因功能验证发现了响应独脚金内酯、茉莉酸、水杨酸诱导的*萎病抗性相关基因GauCCD7和GauCBP1及腺体发育相关新基因GauGRAS1。
简言之，澳洲棉高质量基因组为解析棉花*萎病抗性机理和腺体延缓发育特性提供了重要基础和基因资源。同时也为深入了解棉花进化历史和研究棉花远缘育种供了宝贵资源。
河南大学蔡应繁教授为该文章第一作者，中国农业科学院棉花研究所刘方研究员和河南大学张骁教授为文章的通讯作者。河南科技学院、南京农业大学、安阳工学院、广州基迪奥生物科技有限公司等单位参与了该项研究。蔡小彦、王清连、王苹、张羽、蔡超维、许艳超为文章共同第一作者。该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金和中国农科院科技创新工程的资助。
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